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Colotux Nutzerhandbuch

Laden, Speichern und Vorbereiten von Volumina

Laden

Wählen Sie aus der Menüleiste den Punkt "Load Data" (Daten laden).

Es erscheint ein Dateidialog:

Wählen Sie einen Schichtstapel oder eine bereits vorhandenes 3D32-Datei und Klicken Sie auf "Open".

Aufbereiten der Volumina

Schichtstapel enthalten noch keine Information zur 3D-Darstellung. Diese Informationen müssen zunächst erzeugt werden. ColoTux stellt dazu mehrere mögliche Verfahren zur Verfügung. Um 3d-Ansichten eines geladenenen Schichtstapels zu erhalten, wählen Sie aus der Menüleiste den Punkt "Processing".

Es erscheint eine Auswahl von möglichen Vorverarbeitungsschritten:

Wählen Sie "QuickShow", wenn Sie nur einen "schnellen Blick" auf die 3D-Ansichten werfen wollen. Die Qualität der Darstellung ist dann suboptimal, und Polypen werden nicht gesondert markiert. Dafür läuft dieses Verfahren in ca. 1 Minute komplett durch.

Ansonsten sollten Sie "FastPolys" wählen. Diese Methode braucht zwar länger (ca. 10 Minuten), liefert aber bessere Bilder und markiert Polypen.

Wenn Sie einmal nicht mehr genau wissen, welche Vorverarbeitungsschritte was bewirken, so können Sie einen auswählen und unten "Help" anwählen. Dann erscheint eine kurze Beschreibung des gewünschten Vorverarbeitungsschrittes:

Speichern aufbereiteter Volumina

Damit Sie nicht jedesmal erneut den langwierigen Vorverarbeitungsschritt durchlaufen müssen, empfehlen wir, anschließend die gewonnenen Daten abzuspeichern. Wählen Sie dazu "Save Data" aus der Menüleiste. Es erscheint erneut ein Dateidialog, in dem Sie einen Dateinamen zum Abspeichern der berechneten Daten angeben können:

...weiter

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